干细胞中长链非编码RNA的研究综述
干细胞中长链非编码 RNA 的研究综述
来源:学术堂 作者:周老师
发布于:2016-03-04 共5209 字
随着人类基因组计划的不断推进,人们发现 90% 以上的基因组 DNA 能转录成 RNA,而其中不
足2%编码蛋白质[1-2], 其余不能编码蛋白质的转录产物被称为非编码 RNA (non-coding
RNAs,ncRNAs)[3].根据长度不同,ncRNAs 可以分为短链 ncRNAs 和长链ncRNAs (long
ncRNAs,LncRNAs ).
LncRNAs 缺乏特异完整的开放阅读框,几乎不具有蛋白编码功能。近年来有研究报道 LncRNA
参与干细胞多种生物学特性的调控[4]. 现将对 LncRNAs 在干细胞中的研究进展予以综述,重点
剖析 LncRNAs 与干细胞自我更新和多向分化之间的关联。
1 LncRNAs 的概念。
LncRNAs 是一类长度通常大于 200 个核苷酸,缺少特异完整的开放阅读框,不具有或几乎不
具有蛋白质编码功能的 RNA, 在总 ncRNAs 中占有相当大的比例。LncRNA 起初被认为是基因
“ ”组转录的 噪音 ,因其数量、种类、功能状况均不明确,且尚缺乏有效的研究手段,故又被称作
“ ”基因组中的 暗物质 [5]. 尽管这些 RNA 不能编码蛋白质,却能在基因表达的多个环节( 包括表
观遗传、转录调控以及转录后调控等) 发挥调控作用。
2 LncRNAs 的结构、分类和功能。
LncRNAs 与mRNA 相似,经过剪切,具有多聚腺苷酸( polyA )尾和启动子结
构。LncRNAs 具有较低的进化保守性,其在细胞中的表达水平也明显低于编码蛋白的 RNAs.
大约 2 /3 的LncRNAs 来源于基因之间的广大基因组区域,其余的则来源于与编码蛋白的基因
重叠、反义或基因内区域。根据与编码蛋白基因的位置关系,LncRNAs 大致分为正义(
sense ) 、反义( anti-sense ) 、双向( bidirectional ) 、基因内( intronic ) 和基因间(
intergenic)5 种类型[6]. 通过在不同组织和细胞中进行高通量的 RNA 测序实验发现 LncRNAs
的表达还具有明显的组织和细胞特异性[7-13].近年来大量研究表明,LncRNAs 与许多细胞
学功能有着密切的联系[14-17].如LncRNA 可以作为短链 ncRNAs 的前体,形成微 RNA 以
及内源小干扰 RNA, 还可以作为微 RNA“ ”分子海绵 , 对有活性的微 RNA 产生长效的抑制作用
[15]; 在细胞亚结构以及蛋白复合物的形成过程中 LncRNA “ ”发挥 脚手架 的作用[16],可以将两个
“ ”或两个以上的蛋白分子 绑和 形成复合物。简言之,LncRNAs 可以通过与 ncRNAs,mRNA,基因
组DNA 以及多种蛋白质相互作用在转录、转录后、翻译水平以及表观遗传等多个层面影响细
胞的生命活动。
3 LncRNAs 与干细胞。
干细胞是一类能够自我更新并具有多向分化潜能的细胞。在一定条件下,它们能够分化成多种
成熟的功能细胞。近年来关于 LncRNAs 在干细胞中的研究层出不穷。
摘要:
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干细胞中长链非编码RNA的研究综述来源:学术堂作者:周老师发布于:2016-03-04共5209字随着人类基因组计划的不断推进,人们发现90%以上的基因组DNA能转录成RNA,而其中不足2%编码蛋白质[1-2],其余不能编码蛋白质的转录产物被称为非编码RNA(non-codingRNAs,ncRNAs)[3].根据长度不同,ncRNAs可以分为短链ncRNAs和长链ncRNAs(longncRNAs,LncRNAs).LncRNAs缺乏特异完整的开放阅读框,几乎不具有蛋白编码功能。近年来有研究报道LncRNA参与干细胞多种生物学特性的调控[4].现将对LncRNAs在干细胞中的研究进展予以综述...
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