RNA干扰转基因植物的研发现状

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RNA 干扰转基因植物的研发现状
 摘要:RNA 干扰(RNA interference,RNAi)是指由双链 RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发
同源 mRNA 高效特异性降解的现象,在真核生物中普遍存在且进化保守。RNAi 技术作为 21
纪初的重大科学成就,目前被广泛应用于疾病防治、基因功能研究、植物改良育种等领
域。RNAi 技术常与转基因技术结合用于植物改良育种,通过不同的载体设计或作用途径来研
发满足生产需要的农业生物技术产品。为了明确现阶段基于 RNAi 技术的转基因植物育种技术
进展,综述了 RNAi 现象的发现和作用机制、转基因载体设计、小 RNA(small RNA,sRNA)的递
送方式等方面的研究进展,并阐述了基于 RNAi 技术的转基因植物的研究实例和商业化情况,
以期为相关研究提供参考,从而发挥 RNAi 技术的最大应用价值,使之服务于新时代的农业发
展。
Progress on RNAi-based Transgenic Plants
HUANG Chunmeng ZHU Pengyu WANG Zhi WANG Chenguang DU Zhixin WEI Shuang ZHANG
Yongjiang FU Wei
Chinese Academy of Inspection and Quarantine College of Plant Protection,China Agricultural
University Nanning Customs Technology Center Guangzhou Customs Technology Center
  AbstractRNA interference( RNAi) refers to the phenomenon of high-efficiency and specific
degradation of homologous mRNA induced by double-stranded RNA( dsRNA),which is ubiquitous
and evolutionarily conserved in eukaryotes. RNAi technology,as a major scientific achievement at the
beginning of the 21 st century,is currently widely used in disease prevention,gene function
research,plant improvement and breeding and other fields. RNAi technology is often combined with
transgenic technology for plant improvement and breeding,and agricultural biotechnology products
satisfying production needs are created through different vector designs or action pathways. In order to
clarify the progress on breeding technology of transgenic plants based on RNAi technology,the
research progress of the discovery and mechanism of RNAi phenomenon,the design of transgenic
vectors and the delivery methods of small RNA( sRNA) were reviewed. And the research examples
and commercialization of transgenic plants based on RNAi technology were also elaborated,with a
view to providing reference for related research,thus exerting the maximum application value of RNAi
technology and serving the agricultural development in the new era.
进入 21 世纪以来,生物领域发展十分迅速,然而,我们仍然面临着许多复杂的挑战,其中包
括在保持环境质量的同时保障人口迅速增长所带来的对粮食的需求。这不仅需要最大程度减少
作物病虫害,也需要利用现代生物技术改进现有植物特性,特别是提高作物产量和抗逆性以适
应气候变化。满足这些需求离不开包括 RNA 干扰(RNA interference,RNAi)技术在内的转基因技
术、基因编辑技术以及合成生物学技术[1]RNAi 转基因植物是指基于 RNAi 技术,通过导入
受体植物外源片段产生双链 RNA(double strand RNA,dsRNA)并被加工成小 RNA(small
RNA,sRNA),进而引发与之互补的特定靶基因表达下降或沉默,从而获得的可用于农业生产或
农产品加工的植物及其产品。目前,国内外研发人员已经利用 RNAi 技术开发出具备有害生物
抗性、品质改良、有害物质减少等不同优良性状的生物技术产品。本文基于 RNAi 现象的发现
和作用原理,阐述了 RNAi 转基因植物的设计、dsRNA 或小干扰 RNA(small interfering
RNA,siRNA)的递送方式,并列举了 RNAi 转基因植物的研究实例以及全球部分商业化的 RNAi
转基因植物信息,旨在为 RNAi 技术的应用提供参考,以期能够充分利用 RNAi 技术助力发展
高效绿色友好农业。
    1 RNAi 的发现和作用机制
1.1 RNAi 现象的发现
RNA 沉默是由小分子非RNA(2030nt)引导的,包括多种沉默机制,RNA 降解、翻译
制、色质调控以及 DNA 缺失[2]几乎每个真核生物存在式的 RNA 沉默[3]。以
siRNA RNA(microRNA,miRNA)类型的小 RNA 已得到鉴定并被明参
与了真核生物复杂的生命活动调控如自然产生的反义 RNA(antisense RNA)被发现参与了原核
生物的 DNA 复制、RNA 翻译后调控[4]反义 RNA 通过与靶mRNA 制内源
基因,由产生的结可能会阻碍细胞核的加工、细胞出,导致翻译抑制,进而使靶基因
mRNA 速降解[5]。而且,共抑制表达的正义 RNA(sense RNA)反义 RNA 一样,对靶基
因同具有制作用[6]外,在一个位点上的多拷贝转基因有可能录后基因沉默
(post-transcriptional gene silencing,PTGS) 异常 RNA”概念被引入作为 RNA 度的结
这些异常转物可以用作引物,通过植物编RNA 依赖RNA (RNA-dependent RNA
polymerase,RdRp)来转化 RNA 反义 RNA,最RNA 降解[7]。这个概念适用于转基
因重复引发基因沉默的现象,转基因重复无论程度高都会直接RNA
产物的异常从而RNA 度途径,因为转DNA(transfer DNA,T-DNA)往往
直接重复(direct repeat,DR)者倒置重复(inverted repeat,IR),而期在马铃薯矮牵牛花中的研
究表明转基因低水平的表达与倒置重复紧密相关[8]
同时,转基因重复也被及转录水平基因沉默(transcriptional gene silencing,TGS)。然而,
过程需要内源性 RdRp 的存在,第一种植物编RdRp 番茄中被发现,随后发现其在核
酸酶(ribonuclease,RNase)Ⅲ 家族Dicer Dicer 类似蛋白(Dicer like protein,DCL)作用下
的产物是种新的短单RNA,被siRNAs[9]siRNA dsRNA 和同源 RNA 的引导降解
提供了联系。其实1991 Cameron Jennings[10]观察到动培养细胞的同源转
基因可使转基因发生沉默便提出 dsRNA 可能参与同源性基因沉默的设1998 Fire
[11]在研究秀丽隐杆线(Caenorhabditis elegans)首次证dsRNA 是基因沉默的最要的诱
发因推测在植物中也存在类似机制,并这种由 dsRNA 引发的制特定基因表达的现象
RNAi
了这种典型RNAi 机制,存在由植物自身产生的 miRNA 调控基因表达的现象。1993
,研究者首次线虫中发现 miRNA 途径,并在 2000 定为 Let-7miRNA,同时发现这
种保守途径在线虫和哺乳动物中存在[12]要通过翻译抑制和/或降解同源 mRNA 调节
因的表达。2001 年首次报道了在哺乳动细胞RNAi 技术制内源基因表达[13],进
发展了 RNAi 技术的应用领域和方随后 RNAi 技术逐步应用于疾病治、基因功能研究
和植物育种等领域。
1.2 RNAi 的作用机制
在植物中,RNA 沉默是抵御、转座子和重复基因等核的防机制,通常在
录后水平、转录水平翻译起始水平调控基因表达。RNAi 的核机制分为 3阶段(
1):RNaseⅢDicer 酶将dsRNA 切割siRNA 双链体;选择 siRNA 双链体中的 1链,并
到一种由 Argonaute 蛋白(AGO)成的 RNA 诱导的沉默复合体(RNA-induced silencing
complex,RISC);siRNA 引导 RISC 别并切割同源 mRNA[14]。在些物种中,RNAi 还涉
RdRp,RdRp 可以利用异常 RNA 或同源 mRNA 合成 dsRNA,进一步参与RNAi 次级沉默信
大过程中[14]
1 RNAi 机制示意图[14]
PTGS 途径常常由转基因或病为外源 RNA 沉默途径,分为倒置重复途径(IR-
PTGS)正义途径(S-PTGS)IR-PTGS 途径首先形IR 产物 dsRNA,DCL4 dsRNA 加工
21 nt siRNA,经 3'端甲基化转移酶 HEN1 基化修饰[15]AGO 蛋白形RISC
在引导链 RNA 的引导下对同源 mRNA 行切割降解。而 S-PTGS 途径负责异常 RNA 的降
解。异常 RNA 通常3'polyA 尾巴5'端帽子们被为是来源于高度的转基因
正义/反义 RNA、病RNA 截短型本以及复杂的基因入、基因重复域等。
TGS 途径与 PTGS 途径具有同的作用物,并且是通过靶同源 mRNA DNA
化,最终阻碍 DNA RNA 导的 DNA 基化(RNA-directed DNA methylation,RdDM)
第一个发现的由 sRNA 制的表观遗传机制。RdDM 最初是在烟草植物中发现的,在存在
毒自主RNA 模板RNA 复制的情况下,其 RNA cDNA,并基因
中的cDNA 被特异性基化[16]。研究表明,与启动子区域互补的 dsRNA 可以诱导
动子甲基化和转沉默[17]RdDM 由不同类型列诱导,有不同的靶,常利用 2类型
dsRNA 作为基化诱导物:具有反向重复列的转基因发dsRNA [18]RdDM
不仅是制重复列和病应机制,也是调控基因表达的调节网络部分。
siRNA 所引RNA 沉默现象,miRNA AGO1 的靶基因切割也是种重要的功
能基因沉默式,这在 AGO1 变体互补实中得明。类似于其真核生物,在
miRNA 的引导下,AGO1 mRNA 列的中行切割[19],使被切割mRNA
1个游离的 5'片段和 13'基,3'片段引发解,切割片段由末端尿苷酸移酶
HESO1 3' 对其进行尿酰化,最降解。
植物的 miRNA-靶基因相互作用并不是导AGO 切割,也有可能导致翻译抑制。目前对植物
miRNA 导的翻译抑制的分机制的研究程度不如动物,二者存在相2种常
的转录后调控模式外,植物 miRNA 也可以进入RdDM 机制中。在这种情况下,miRNA 前体
DCL 3 理产生长的片段(24 nt),并被AGO4/6/9 系统以引导 DNA 列发生
修饰,进而在转录水平调控基因表达[20]。目前已在水稻中发现了这miRNA 的具体实例,
其中有一类 miRNAs DCL3 理,AGO4 引导 DNA 基化[21]
    2 RNAi 转基因植物的研发现状
RNAi 技术应用于植物育种多用外源导入 T-DNA 的方式,将正义 RNA反义 RNA 者倒置
重复的靶基因放置定的启动子dsRNA,并进一步加工成 siRNA 进入 RNAi 途径
调控植物发育,从而达育种目的。外,也有人工 miRNA 的途径和利用 Rd DM 的途径,
后者能够对靶基因的启动子观遗传修饰从而调控靶基因表达以改变植物农性状。本文
从转基因设计、sRNA 递送方式、RNAi 转基因植物的研究实例 3个角度来阐述 RNAi 转基因植
物的研发现状。
2.1 RNAi 转基因设计
2.1.1 正义反义 RNA
通过表达 mRNA 正义反义本,引入用于植物沉默的转基因 dsRNA法依
于由 2个独立的互补 RNA 获得的用于 RNA 沉默的 dsRNA尽管单独使用反义
物相的效未显著提高,且小于使用 IR 的方[22]是,正义反义
本可以在相启动子行聚合转,这种设计缩短了所需的 T-DNA 的长度,并避免
复使用列。通过虫和果蝇的转基因实验证实了存在通过合转RNAi 导的基因
[23]
2.1.2 含子嵌入的倒置重复
有时为了获得理的表含子整合进反向重复域作为一个保守的调控元件来保基因
特异性的表达和制。最常用的 RNA 沉默转基因结是包1间隔序列分倒置
重复 IR 列。经过转IR dsRNA 并被加工成为成siRNA 以有效沉默靶基因。
间隔序列可以是与靶标无关的任何序列,使用内含子衍生的可间隔可以增加沉默效
[24]了植物,基因内含子衍生的人工RNA(short hairpin RNA,shRNA)也能在哺乳动
细胞中诱导基因沉默[25]。有时在育种中加理的表性状,在表达一个基因的同
另一个基因的表达。在高赖氨酸的基因工程玉米中,表达赖氨酸反馈敏感的生物
合成CordapA 制内源赖氨酸酮戊二酸还/酵母氨酸脱氢(lysine ketoglutarate
reductase/yeastine dehydrogenase,LKR/SDH)累积可以最大程度提高成籽粒赖氨酸
积累,从而获得高赖氨酸含量的玉米品种[26],在这赖氨酸含量的玉米中,制内源基因
的设计入内含子倒置重复列。
2.1.3 人工 miRNA
内源性 miRNA 列可以被设计成人工 miRNA(artificial miRNA,AmiRNA)AmiRNA 首次
是在人的细胞系中,内源性 miRNA 前体经修饰产生 AmiRNA,从而选择制互补靶
[27]。在哺乳动细胞中,尽管 RNAi 已经被明是有效的,dsRNA 用于 RNA 沉默的途径
是有的。数胚胎细胞培养系统外,dsRNA 可诱导翻译抑[28]。因,由miRNA
前体产生的 shRNAs 常被用于沉默系统中的内源性基因[29]。现有的研究已经出使 sRNA
有效的发挥 RNA 沉默作用的途径和原:miRNAs 中,来5'28(子区)
苷酸位置可能是靶特异性的最重要的定因[30];sRNA 双链中5'端处于不
的链RISC[31];GC 量在 30%50%[32];具有 5-尿苷sRNA 可优先装
AGO1[33]。同样地miRNAs 也能基因和内源性基因在植物中的表达[34]。有学
摘要:

RNA干扰转基因植物的研发现状 摘要:RNA干扰(RNAinterference,RNAi)是指由双链RNA(double-strandedRNA,dsRNA)诱发同源mRNA高效特异性降解的现象,在真核生物中普遍存在且进化保守。RNAi技术作为21世纪初的重大科学成就,目前被广泛应用于疾病防治、基因功能研究、植物改良育种等领域。RNAi技术常与转基因技术结合用于植物改良育种,通过不同的载体设计或作用途径来研发满足生产需要的农业生物技术产品。为了明确现阶段基于RNAi技术的转基因植物育种技术进展,综述了RNAi现象的发现和作用机制、转基因载体设计、小RNA(smallRNA,sRNA)的递送方...

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